Struktur organisasi ISSA terdiri dari ketua, sekretaris, bendahara, divisi kerjasama, divisi publikasi dan layanan informasi di tingkat pusat dan cabang di seluruh Indonesia. Anggota ISSA terdiri dari :
- Anggota biasa,
- Anggota luar biasa dan
- Anggota Kehormatan.
Sampai terbentuknya kepengurusan ISSA Pusat, seluruh tanggung jawab dan wewenang ISSA pusat dipegang oleh formatur